Руководство текущей деятельностью АО «ЧЭР» осуществляет Генеральный директор, избрание которого отнесено к компетенции Совета директоров АО «ЧЭР». Генеральный директор избирается большинством голосов членов Совета директоров, принимающих участие в заседании.  

К компетенции Генерального директора Общества относятся все вопросы руководства текущей деятельностью Общества, за исключением вопросов, отнесенных к компетенции Общего собрания акционеров и Совета директоров Общества.

Генеральный директор Общества без доверенности действует от имени Общества, в том числе, с учетом ограничений, предусмотренных законодательством Российской Федерации, Федеральным законом "Об акционерных обществах", Уставом и решениями Совета директоров Общества.

С 22 июня 2023 г. на должность Генерального директора Общества назначен Торощин Данил Сергеевич.